裙带菜配子体在性成熟阶段,可以形成精子囊和卵囊,进而分别产生精子和卵子。所以,我们可根据形成卵囊或精子囊或二者兼有来确切判断其性别,在营养生长阶段:
因此可以根据上述形态特点判别雌性与雄性配子体。

此外,海藻种质库的研究人员发现了裙带菜雌性特异的 DNA 分子标记,可用于检验配子体的性别。
此外,法国的研究人员还开发了雌性裙带菜与雄性裙带菜特异的 DNA 标记。
由于处于营养生长阶段的配子体的形态受环境影响较大,因此利用 DNA 性别特异标记能够更准确地鉴定性别。但是 DNA 分子标记不能完全解决判断雌雄同体性别的问题,因为雌雄同体配子体只具有雄性特异的 DNA 标记,所以用 DNA 分子标记法只能辅助检测雌雄同体性别表型。