法不溯及既往是指不能用现在的法律,评价法律颁布之前的行为,这只是法律适用的问题,说简单点你用哪部法律来判他。
超过追诉期是指行为发生时间到立案审判时间太久,超过了诉讼时效,不再追究刑事责任,哪怕是犯罪也不再管了。
比如1948年杀人,现在才发现真凶。明显就是超过追诉期的事。假设刑法现在修改一条,故意杀人行为追诉期调整为100年。那么1925年~今天发生的杀人行为,都可以追究他的刑事责任,只不过具体审判时,看是适用1925年的法律还是今天的法律,同时会参照现行刑法从旧兼从轻。
最后分析1948年的杀人行为今天不管的原因?是因为他已经超过最长的法定追诉期20年。而不是因为他发生在1979年之前。